Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphs1Q9QZS7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphs1Q9QZS7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphs1Q9QZS7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphs1Q9QZS7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphs1Q9QZS7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nphs1Q9QZS7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms