Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ehd3Q9QXY6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ehd3Q9QXY6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd3Q9QXY6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ehd3Q9QXY6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms