Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sall2Q9QX96 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sall2Q9QX96 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sall2Q9QX96 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sall2Q9QX96 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sall2Q9QX96 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sall2Q9QX96 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Sall2Q9QX96 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sall2Q9QX96 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sall2Q9QX96 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sall2Q9QX96 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sall2Q9QX96 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms