Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sfmbt1Q9JMD1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sfmbt1Q9JMD1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfmbt1Q9JMD1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfmbt1Q9JMD1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms