Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms