Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SacsQ9JLC8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SacsQ9JLC8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SacsQ9JLC8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SacsQ9JLC8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SacsQ9JLC8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SacsQ9JLC8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SacsQ9JLC8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SacsQ9JLC8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SacsQ9JLC8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SacsQ9JLC8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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