Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufaf3Q9JKL4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufaf3Q9JKL4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufaf3Q9JKL4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms