Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3glb1Q9JK48 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3glb1Q9JK48 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3glb1Q9JK48 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3glb1Q9JK48 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms