Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Wdr12Q9JJA4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr12Q9JJA4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr12Q9JJA4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr12Q9JJA4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdr12Q9JJA4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr12Q9JJA4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr12Q9JJA4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr12Q9JJA4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr12Q9JJA4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr12Q9JJA4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr12Q9JJA4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms