Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ26

Mefv, Pyrin, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MefvQ9JJ26 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MefvQ9JJ26 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MefvQ9JJ26 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MefvQ9JJ26 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MefvQ9JJ26 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MefvQ9JJ26 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MefvQ9JJ26 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MefvQ9JJ26 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MefvQ9JJ26 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MefvQ9JJ26 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MefvQ9JJ26 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MefvQ9JJ26 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MefvQ9JJ26 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MefvQ9JJ26 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms