Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnmb4Q9JIN6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnmb4Q9JIN6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnmb4Q9JIN6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kcnmb4Q9JIN6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnmb4Q9JIN6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnmb4Q9JIN6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnmb4Q9JIN6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnmb4Q9JIN6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms