Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sphk2Q9JIA7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sphk2Q9JIA7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sphk2Q9JIA7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sphk2Q9JIA7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sphk2Q9JIA7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms