Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl1Q9JI74 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl1Q9JI74 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl1Q9JI74 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl1Q9JI74 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl1Q9JI74 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl1Q9JI74 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl1Q9JI74 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl1Q9JI74 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl1Q9JI74 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Klhl1Q9JI74 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl1Q9JI74 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl1Q9JI74 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl1Q9JI74 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms