Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2ird1Q9JI57 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2ird1Q9JI57 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2ird1Q9JI57 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2ird1Q9JI57 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2ird1Q9JI57 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2ird1Q9JI57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2ird1Q9JI57 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2ird1Q9JI57 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2ird1Q9JI57 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2ird1Q9JI57 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2ird1Q9JI57 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2ird1Q9JI57 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms