Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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