Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ripk4Q9ERK0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ripk4Q9ERK0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ripk4Q9ERK0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ripk4Q9ERK0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ripk4Q9ERK0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ripk4Q9ERK0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ripk4Q9ERK0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ripk4Q9ERK0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ripk4Q9ERK0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ripk4Q9ERK0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ripk4Q9ERK0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ripk4Q9ERK0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ripk4Q9ERK0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ripk4Q9ERK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ripk4Q9ERK0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ripk4Q9ERK0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ripk4Q9ERK0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms