Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER04

Tmprss5, Transmembrane protease serine 5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss5Q9ER04 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmprss5Q9ER04 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmprss5Q9ER04 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmprss5Q9ER04 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmprss5Q9ER04 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmprss5Q9ER04 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmprss5Q9ER04 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmprss5Q9ER04 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmprss5Q9ER04 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmprss5Q9ER04 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmprss5Q9ER04 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmprss5Q9ER04 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmprss5Q9ER04 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms