Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCV7

Krt7, Keratin, type II cytoskeletal 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt7Q9DCV7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt7Q9DCV7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt7Q9DCV7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt7Q9DCV7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt7Q9DCV7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt7Q9DCV7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt7Q9DCV7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt7Q9DCV7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt7Q9DCV7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt7Q9DCV7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt7Q9DCV7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt7Q9DCV7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt7Q9DCV7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt7Q9DCV7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt7Q9DCV7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt7Q9DCV7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt7Q9DCV7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms