Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ndufa8Q9DCJ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ndufa8Q9DCJ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ndufa8Q9DCJ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ndufa8Q9DCJ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ndufa8Q9DCJ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ndufa8Q9DCJ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ndufa8Q9DCJ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ndufa8Q9DCJ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ndufa8Q9DCJ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ndufa8Q9DCJ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ndufa8Q9DCJ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms