Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3fQ9DCH4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3fQ9DCH4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Eif3fQ9DCH4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Eif3fQ9DCH4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms