Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ftsj3Q9DBE9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ftsj3Q9DBE9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Ftsj3Q9DBE9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ftsj3Q9DBE9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ftsj3Q9DBE9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms