Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift43Q9DA69 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift43Q9DA69 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ift43Q9DA69 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ift43Q9DA69 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms