Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc70Q9D9B0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc70Q9D9B0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc70Q9D9B0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc70Q9D9B0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms