Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TcimQ9D915 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TcimQ9D915 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TcimQ9D915 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TcimQ9D915 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TcimQ9D915 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TcimQ9D915 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TcimQ9D915 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TcimQ9D915 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TcimQ9D915 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TcimQ9D915 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TcimQ9D915 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TcimQ9D915 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TcimQ9D915 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms