Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec11cQ9D8V7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sec11cQ9D8V7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sec11cQ9D8V7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sec11cQ9D8V7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms