Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl17Q9D8P4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl17Q9D8P4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl17Q9D8P4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl17Q9D8P4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl17Q9D8P4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl17Q9D8P4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl17Q9D8P4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl17Q9D8P4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl17Q9D8P4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl17Q9D8P4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms