Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ifi35Q9D8C4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ifi35Q9D8C4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ifi35Q9D8C4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ifi35Q9D8C4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ifi35Q9D8C4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ifi35Q9D8C4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ifi35Q9D8C4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifi35Q9D8C4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifi35Q9D8C4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifi35Q9D8C4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifi35Q9D8C4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifi35Q9D8C4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifi35Q9D8C4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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