Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop56Q9D6Z1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop56Q9D6Z1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop56Q9D6Z1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nop56Q9D6Z1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nop56Q9D6Z1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.1 ms