Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lpcat2bQ9D5U0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpcat2bQ9D5U0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lpcat2bQ9D5U0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms