Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stag1Q9D3E6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stag1Q9D3E6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stag1Q9D3E6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stag1Q9D3E6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stag1Q9D3E6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stag1Q9D3E6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stag1Q9D3E6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stag1Q9D3E6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stag1Q9D3E6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stag1Q9D3E6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag1Q9D3E6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag1Q9D3E6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag1Q9D3E6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stag1Q9D3E6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stag1Q9D3E6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Stag1Q9D3E6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stag1Q9D3E6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stag1Q9D3E6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag1Q9D3E6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms