Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps33aQ9D2N9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps33aQ9D2N9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps33aQ9D2N9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps33aQ9D2N9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33aQ9D2N9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms