Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc6bQ9D289 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc6bQ9D289 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trappc6bQ9D289 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc6bQ9D289 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc6bQ9D289 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms