Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zbed3Q9D0L1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zbed3Q9D0L1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zbed3Q9D0L1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zbed3Q9D0L1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zbed3Q9D0L1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zbed3Q9D0L1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zbed3Q9D0L1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zbed3Q9D0L1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zbed3Q9D0L1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zbed3Q9D0L1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Zbed3Q9D0L1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zbed3Q9D0L1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms