Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc47Q9D024 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc47Q9D024 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc47Q9D024 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc47Q9D024 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc47Q9D024 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc47Q9D024 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms