Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed5Q9CXE7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed5Q9CXE7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmed5Q9CXE7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed5Q9CXE7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms