Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx2Q9CWK8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx2Q9CWK8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx2Q9CWK8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx2Q9CWK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx2Q9CWK8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx2Q9CWK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx2Q9CWK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx2Q9CWK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Snx2Q9CWK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx2Q9CWK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms