Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Txndc17Q9CQM5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Txndc17Q9CQM5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Txndc17Q9CQM5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Txndc17Q9CQM5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms