Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rab5aQ9CQD1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab5aQ9CQD1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab5aQ9CQD1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms