Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2a1Q99PM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2a1Q99PM3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2a1Q99PM3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2a1Q99PM3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2a1Q99PM3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2a1Q99PM3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2a1Q99PM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287.5 ms