Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scd3Q99PL7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scd3Q99PL7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scd3Q99PL7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scd3Q99PL7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scd3Q99PL7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms