Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpnmbQ99P91 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GpnmbQ99P91 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GpnmbQ99P91 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GpnmbQ99P91 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GpnmbQ99P91 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms