Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Rims1Q99NE5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rims1Q99NE5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rims1Q99NE5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rims1Q99NE5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rims1Q99NE5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rims1Q99NE5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Rims1Q99NE5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rims1Q99NE5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rims1Q99NE5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Rims1Q99NE5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rims1Q99NE5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rims1Q99NE5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rims1Q99NE5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rims1Q99NE5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rims1Q99NE5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rims1Q99NE5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rims1Q99NE5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rims1Q99NE5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rims1Q99NE5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rims1Q99NE5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rims1Q99NE5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rims1Q99NE5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Rims1Q99NE5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rims1Q99NE5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rims1Q99NE5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Rims1Q99NE5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rims1Q99NE5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rims1Q99NE5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rims1Q99NE5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rims1Q99NE5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Rims1Q99NE5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rims1Q99NE5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rims1Q99NE5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rims1Q99NE5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms