Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cstf3Q99LI7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cstf3Q99LI7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cstf3Q99LI7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cstf3Q99LI7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cstf3Q99LI7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms