Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pagr1aQ99L02 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Pagr1aQ99L02 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pagr1aQ99L02 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pagr1aQ99L02 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pagr1aQ99L02 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pagr1aQ99L02 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pagr1aQ99L02 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pagr1aQ99L02 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pagr1aQ99L02 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pagr1aQ99L02 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pagr1aQ99L02 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pagr1aQ99L02 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pagr1aQ99L02 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pagr1aQ99L02 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pagr1aQ99L02 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms