Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ3

Csdc2, Cold shock domain-containing protein C2, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csdc2Q91YQ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms