Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps36Q91XD6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps36Q91XD6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps36Q91XD6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps36Q91XD6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps36Q91XD6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps36Q91XD6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps36Q91XD6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms