Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp9Q91WM3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp9Q91WM3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp9Q91WM3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Rrp9Q91WM3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rrp9Q91WM3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rrp9Q91WM3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms