Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc71Q8VEG0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc71Q8VEG0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc71Q8VEG0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc71Q8VEG0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc71Q8VEG0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc71Q8VEG0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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