Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmpQ8R373 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClmpQ8R373 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ClmpQ8R373 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ClmpQ8R373 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClmpQ8R373 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms