Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh16f2Q8K3M1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh16f2Q8K3M1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms